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Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

AI正以一种比变魔术还快的方式重塑大分子药物研发

  • “一键设计即成功”?这不是网购下单,而是蛋白质绑定的逆天操作!*
  • 想象一下:科学家们正从“高通量筛选地狱”迈向“AI一键设计天堂”——最新登场的BindCraft工具完全诠释了什么叫”设计一时爽“。

    这项发表在Nature上的”黑科技”有什么特别?

  • 研发团队:瑞士洛桑联邦理工学院+美国麻省理工学院的大脑集合体
  • 核心功能:不再需要把实验室变成筛子工厂,AI直接给你最优解
  • 成功率:设计结果可以直接去申请”蛋白质世界相亲大会”的最佳亲和力奖
  • “AI现在都能给蛋白质当红娘了,人类还在头疼相亲穿什么…”*
  • 这个名为BindCraft的平台简直像是给制药行业开了个作弊码——传统方法可能需要几个月甚至几年的工作量,现在可能一杯咖啡的时间就能搞定。

  • 未来药企CEO可能会这样训斥员工:”为什么还在用老方法?你以为我们是古代人吗?”*
  • (备注:本文不含任何魔法成分,但AI的表现确实让人怀疑是不是偷偷学了点法术)*
  • Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

    蛋白质设计的”懒人革命”:BindCraft如何让科学家们集体失业?

  • 传统方法 vs BindCraft:一场悬殊的较量*
  • 传统蛋白质设计:成功率0.1%,研究者可能白头搔更短,浑欲不胜发
  • BindCraft:成功率46.3%,简直就是生物学界的”作弊码”,让效率暴涨400倍
  • 火力全开的蛋白质设计神器*
  • BindCraft不仅能像精准狙击手般:

  • 搞定PD-1、PD-L1等重要靶点
  • 轻松达到纳摩尔级别的亲和力
  • 还附带”买一送三”功能:
  • 可以调教CRISPR-Cas9这个基因剪辑狂魔
  • 为AAV病毒装上GPS导航系统(喏,这就是所谓的”靶向蛋白”)
  • 完全开源,让每个实验室都能一夜暴富(知识上的)
  • 科学家们的集体吐槽*
  • “我们熬夜几个月的工作,BindCraft一杯咖啡的时间就搞定了?”
    ——某不愿透露姓名的蛋白质设计研究员

  • 未来展望*
  • 随着越来越多的AI工具加入研究大军,制药公司可能要开始担心:

  • 实验室小白鼠的失业危机
  • 原本需要十年的新药研发,现在可能只需要…一个程序员午休的时间?
  • 备注:本报道可能包含轻微乐观主义倾向,具体疗效请以实际科研为准。*
  • Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

    当蛋白质设计变成”一键搞定”:科技让分子设计比泡面还简单

    传统的蛋白质设计师们可能还在实验室里焦头烂额地调试参数,但BindCraft却玩出了新花样——直接召唤AlphaFold2 Multimer来反向传播(没错,就是那种能让你想起数学课上脑袋爆炸的东西),直接在目标蛋白的”地盘”上凭空生成结合分子的结构与序列!

    这个黑科技的魔法三步曲

  • 从零创造,绝不抄袭:不像某些”参考借鉴”法,BindCraft直接让AI自己动手从头设计结合分子,不依赖数据库,不靠运气。
  • MPNN来优化:为了避免你设计的蛋白质像个没折好的纸团,MPNN模型会优雅地调整序列,确保它不仅能表达,还能稳定、可溶,不给你找麻烦。
  • AlphaFold2单体筛选:如果前两步是”创造”,那这一步就是”面试官”——只挑可靠的候选者,让你的实验成功率飙升。
  • 为什么科学家们激动得想跳舞?

  • 效率爆表:传统方法成功率0.1%BindCraft直接飙到46.3%,翻了400多倍!
  • 85种蛋白质全进实验验证环节,没一个被AI当场踢出局。
  • 砸碎门槛:过去这玩意儿是专家专属,现在连学生都能玩转,简直比点外卖还方便。
  • 于是,抗体药物研发从此可能从”马拉松”变成”百米冲刺”。未来?也许设计师们只需喝杯咖啡,等着AI告诉他们:”恭喜,您的新分子设计已经完成!”
    Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

    AI化身科学界的”蛋白质米其林大厨”:从抗体药到抗过敏,样样精通!

    1. PD-1结合剂:免疫疗法的”火箭推进器”

    在这个免疫治疗内卷的时代,AI生成的PD-1结合剂就像是游戏外挂——亲和力飙到亚纳摩尔级,相当于在靶点上”锁死车门”,让肿瘤细胞彻底无路可逃!下一代免疫疗法可能比点外卖还快诞生。

    2. 抗过敏新武器:让花粉症患者笑着打喷嚏

    科研人员拿着AI设计的”过敏原抓捕器”(亲和力13 nM),成功让过敏性反应吓得抱头鼠窜。未来抗过敏药可能不再是”吃了就困”的昏睡套餐,而是精准的分子保镖,专治各种不服的免疫系统!

    3. 基因编辑”紧急刹车”:SpCas9的终极遥控器

    基因编辑太猛怕翻车?AI设计的抑制蛋白直接给基因剪刀装上自毁按钮,效果比天然抑制剂还强。从此基因治疗可以放心玩”精准微操”,再也不用担心细胞变成科学怪人!

    4. 专啃硬骨头:从人造蛋白到天然毒素,通通拿下

    AI仿佛在说:”传统靶点太无聊,我们要挑战地狱难度!”不管是人造蛋白还是致命毒素,BindCraft都能像魔术师一样变出完美结合剂,堪称生物医药界的”万能钥匙匠”。

    5. AI厨房的科学大餐:X射线、冷冻电镜齐上阵

    研究人员动用X射线晶体学、冷冻电镜等豪华装备验证AI作品,场面堪比米其林评审团检测分子料理。结果?”这蛋白结构比瑞士手表还精致!”

    AI蛋白质设计界的”速度与激情”

    另一边,OpenAI支持的Chai-2直接让抗体设计进入“两周快闪模式”(传统方法:您已落后100倍)。零样本生成抗体?成功率两位数?科学界惊呼:”这AI怕不是偷看了造物主的笔记本!”

    未来展望

    当AI开始玩转蛋白质,生物医药恐怕要迎来“智能制药2.0″时代——

  • 药物研发:从”马拉松”变”百米冲刺”
  • 抗过敏:从”昏睡套餐”升级为”精准拦截”
  • 基因编辑:从”盲盒操作”变成”安全外科手术”
  • 一句话总结:AI不仅在设计蛋白质,更在重新定义医学的可能性!
    Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

    蛋白质设计竞赛:30分钟KO默克老牌药物!

    2024年Adaptyv蛋白质设计竞赛再次证明了一点:科学家们现在改行当”蛋白质裁缝”,比AI剪视频还快!

  • 来看看这场疯狂的数据秀:*
  • 130位顶尖选手(大概相当于生物学界的”复仇者联盟”阵容)
  • 30位”蛋白质月老”成功配对了至少一种结合物
  • 53/400种蛋白成功牵手EGFR(成功率14%,比三个月前直接暴增5倍!)
  • 最离谱的剧情来了:*
  • 冠军Cradle公司只用30分钟优化的蛋白质版”相亲简历”,居然就秒杀了默克的经典药物西妥昔单抗(cetuximab)!
    (默克团队内心OS:“我们花几年时间研究的药,怎么就输给半小时的’AI相亲速配’了?!”
    Nature重磅! BindCraft AI一站式蛋白质设计平台震撼全场,成功率提升400倍,开源即用,抗体研发一夜变天!

    AI时代,蛋白质设计也能”PS”了?

    长期以来,科学家们在蛋白质设计中像个大海捞针专业户,凭借经验和运气一点点筛选最优解。但现在,AI的出现,让这个过程仿佛升级成了“生物学的Photoshop”——不仅能精准修饰,还能一键优化!

    三个AI蛋白质设计案例

  • Cradle
  • 目标:打造“生物学家的Photoshop”
  • 效果:让蛋白质设计像修图一样顺手
  • 百奥几何
  • 战绩:60天、3轮迭代
  • 成果:IVD试剂用酶产量狂飙21倍(野生型哭晕在实验室)
  • 分子之心
  • 操作:AI改造抗体
  • 成就:2个月筛选10个候选分子
  • 附带Buff:pH敏感性拉满,半衰期大增(堪称抗体界的”续航之王”)
  • 为什么AI这么牛?

  • 旧模式:靠经验+大量湿实验(≈ 科学家手动”挖矿”)
  • 新模式:AI从数据海洋里自动捞金子,还能精准预测最优解
  • 未来展望:编程蛋白就像写代码?诺贝尔奖得主Demis Hassabis甚至预言:AI或让人类十年内告别疾病!
  • (原文来源:微信公众号“智药局”,作者世晨

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